Ещё несколько лет назад единственной возможностью для изучения ДНК животных было извлечение образца из их тела. Однако сейчас учёные могут собирать и анализировать так называемую экологическую ДНК (или эДНК), которую получают "из воздуха", а именно – из различных образцов в окружающей среде.
В британском научном журнале Current Biology недавно опубликовали работы двух исследовательских групп, которые трудились независимо друг от друга (одна базируется в Дании, а другая – в Великобритании и Канаде). Обеим командам удалось идентифицировать животных, скрывающихся поблизости (как внутри, так и за пределами зоопарков), чью экологическую ДНК они получили.
"Мы не думали, что сможем собрать ДНК животных буквально из воздуха, – говорит в опубликованной статье доцент Копенгагенского университета и ведущий автор датского исследования Кристин Боманн. – Это был высокий риск, однако с возможностью расширить границы биомониторинга позвоночных. Было понятно, что то, что мы знаем, ещё не предел".
Оба эксперта согласны с тем фактом, что если две исследовательские группы смогли независимо друг от друга продемонстрировать способность экологической ДНК быть использованной в качестве мониторинга разновидностей животных, то их выводы становятся более весомыми и показывают потенциал такой технологии.
Каким образом эДНК собирают "из воздуха"?
Элизабет Клэр, доцент Йоркского университета в Канаде, объясняет Metro:
– Процедура, которую мы разработали, немного похожа на то, как вы делаете кофе. Вы "прогоняете" воду через фильтр и получаете гущу. Представьте, что гуща – это ДНК. Мы "вытягиваем" через фильтр воздух и ищем частицы генетического материала в окружающей нас среде.
Эксперт. Элизабет Клэр, доцент Йоркского университета в Канаде
- Что такое экологическая ДНК?
- Это любой генетический материал, который мы собираем не напрямую из тела животного. К примеру, мы регулярно отфильтровываем ДНК из пробы воды для того, чтобы изучать популяции рыб. И нам не нужно для этого видеть животное или быть рядом с ним.
- Как с помощью эДНК обнаружить находящихся под угрозой исчезновения животных?
- Мы нацелены на небольшое количество ДНК, которое можно использовать для различения видов. Мы фильтруем ДНК, а затем получаем формальное описание первичной структуры этого генетического материала и анализируем его. Мы сравниваем данные с "библиотекой" уже имеющихся ДНК, чтобы идентифицировать источники. Так, мы можем различать разные виды животных, а затем определять, какие из них обитают в той или иной области.
- Что же дальше?
- Мы ещё многого не знаем об эДНК. Понятия не имеем, как долго она сохраняется, как далеко может распространяться и как лучше её собирать. Сейчас нам нужно совершенствовать технологию, чтобы сделать её эффективной и понять, как генетический материал может перемещаться по экосистеме.